Akadeemia juures tegutsevad ekspertkogud
Arstiteaduse ja tervishoiu strateegia alaline komisjon
Esimees: Eero Vasar
Liikmed: Toomas Asser, Priit Kaasik, Margus Lember, Andres Metspalu, Urmas Siigur, Joel Starkopf, Raivo Uibo, Mart Ustav, Toomas Veidebaum.
Moodustatud 2011
Eesti polaaruuringute komisjon
Esimees: Rein Vaikmäe
Teadussekretär: Enn Kaup
Liikmed: Riina Kaljurand, Maarja Kruusmaa, Tarmo Kõuts (viitseadmiral), Tuuli Levandi, Kati Lindström, Jüri Martin, Timo Palo, Mart Saarso, Martin Zobel, Andres Tarand, Priit Tisler, Aimar Ventsel.
Moodustatud 1993
Eesti polaaruuringute komisjoni kaudu osaleb akadeemia Euroopa polaarnõukogu töös.
Eesti teaduse tippkeskuste nõukogu
Esimees: Andres Metspalu
Liikmed: Maarja Kruusmaa, Jarek Kurnitski, Mare Kõiva, Enn Lust, Urmas Nagel, Ülo Niinemets, Martti Raidal, Tanel Tenson.
Moodustatud 2012
Energeetikakomisjon
Esimees: Arvi Hamburg
Liikmed: Andres Annuk, Marti Jeltsov, Tiit Kallaste, Marco Kirm, Ando Leppiman, Enn Lust, Leo Mõtus, Leevi Mölder, Allan Niidu, Henri Ormus, Joonas Pärenson, Martti Raidal, Ülo Rudi, Toomas Rõõm, Katrin Saarsalu-Layachi, Andres Siirde, Andro Truuverk.
Moodustatud 1998
Hariduskomisjon
Esimees: Jakob Kübarsepp
Liikmed: Eve Eisenschmidt, Larissa Jõgi, Birute Klaas-Lang, Äli Leijen, Krista Loogma, Rain Mikser, Katrin Niglas, Margus Pedaste, Miia Rannikmäe, Priit Reiska, Ellu Saar, Peeter Sipelgas, Marek Tamm, Ain Tõnisson, Urmo Uiboleht, Krista Uibu.
Moodustatud 2022
Keskkonnakomisjon
Esimees: Urmas Kõljalg
Aseesimehed: Olle Hints, Urmas Tartes
Liikmed: Anne Kahru, Kalle Kirsimäe, Toomas Kukk, Agu Leivits, Timo Maran, Kalev Sepp, Uudo Timm, Asta Tuusti, Kaili Viilma.
Moodustatud 2023 varasemate fülogeneetika ja süstemaatika komisjoni ning looduskaitse komisjoni asemele.
Kirjastusnõukogu
Esimees: Jaak Järv (peatoimetaja)
Liikmed: Olle Hints, Valter Lang, Andres Siirde, Gerson Stefan Klumpp, Urmas Sutrop, Marek Tamm, Jüri Engelbrecht, Marco Kirm, Karl Pajusalu, Piret Lukkanen.
Kirjastusnõukogu töö aluseks on Eesti Teaduste Akadeema Kirjastuse põhimääruse punktid 23–28.
Küberturvalisuse komisjon
Esimees: Dan Bogdanov
Liikmed: Alo Einla, Arne Koitmäe, Kristjan Krips, Ivo Kubjas, Liisa Past, Teet Raidma,
Mihkel Solvak, Ahto Truu,
Tarmo Uustalu, Priit Vinkel, Jan Willemson.
Teaduste akadeemia juhatuse otsus komisjoni moodustamise kohta.
Moodustatud 2023 varasema küberkaitse komisjoni asemele.
Mereteaduste komisjon
Esimees: Tarmo Soomere
Liikmed: Rivo Uiboupin, Georg Martin, Alar Rosentau, Kalle Olli, Tiina Nõges, Hannes Tõnisson, Sirli Sipp Kulli, Katariina Viik.
Moodustatud 2007
Meteoriitika komisjon
Esimees: Jüri Plado
Liikmed: Juho Kirs, Tõnu Pani, Karin Truuver, Sten Suuroja, Reet Tiirmaa, Siim Veski.
Moodustatud 1954
Välisvahetuse fondi nõukogu
Esimees: Jüri Engelbrecht
Liikmed: Marco Kirm, Äli Leijen, Katrin Niglas, Toomas Vaimann.
Moodustatud 1993