Nikolai Alumäe medal
informaatika ja tehnikateaduste alal.
Autasustatud
Jüri Engelbrecht – 2005
Hillar Aben – 2009
Raimund-Johannes Ubar – 2013
Rein Küttner – 2018
Paul Ariste medal
humanitaarteaduste alal (kuni aastatni 2020 sotsiaal- ja sotsiaal- ja humanitaarteaduste alal).
Autasustatud
Tiit-Rein Viitso – 2005
Huno Rätsep – 2010
Arvo Krikmann – 2014
Jaak Kangilaski – 2020
Karl Ernst von Baeri medal
elu- ja maateaduste alal.
Autasustatud
Loit Reintam – 2007
Ülo Mander – 2011
Richard Villems – 2015
Martin Zobel – 2022
Harald Kerese medal
astronoomia, füüsika ja matemaatika alal.
Autasustatud
Ülo Lepik – 2013
Jaan Einasto – 2019
Wilhelm Ostwaldi medal
keemias ja sellega seotud valdkondades.
Autasustatud
Viktor Palm – 2006
Ilmar Koppel – 2010
Mati Karelson – 2014
Karl Schlossmanni medal
arstiteaduses ja sellega seotud valdkondades.
Autasustatud
Mart Saarma – 2004
Lembit Allikmets – 2008
Ain-Elmar Kaasik – 2012
Eero Vasar – 2016
Irja Lutsar – 2020